ÚKE SAV je interdisciplinárny vedecký ústav pre základný a aplikovaný výskum, ako aj pre koordináciu, vypracovávanie krajinnoekologických metodík, plánov a projektov. Na tomto ústave vznikla metodika krajinnoekologického plánovania - LANDEP. Medzinárodný význam pracoviska potvrdzuje aj skutočnosť, že metodiku LANDEP obsahuje Agenda 21 z Rio Summitu ´92 ako odporúčanú podkladovú metodiku pre integrovaný prístup k manažmentu prírodných zdrojov (kapitola 10 Agendy 21).

Ústav bol prvým a po dlhé roky jediným školiacim pracoviskom pre vedný odbor ekológia, špecializácia krajinná ekológia. V súčasnosti školí doktorandov v študijnom odbore č. 4.3.1 Ochrana prírody a využívanie krajiny.

Vedecké výsledky ústavu majú charakter základného, ale i strategického aplikovaného výskumu. Základný krajinnoekologický výskum bol zameraný na rozpracovávanie metodiky LANDEP, environmentálneho hodnotenia územia, mapovanie biotopov a biomonitoring. Aplikovaný výskum vyplýval z celospoločenskej požiadavky a sledoval za cieľ prenos krajinnoekologických poznatkov do procesu rozhodovania, manažmentu, plánovacieho procesu a environmentálnej politiky. Súčasťou tohto výskumu je aj expertízna činnosť v oblasti krajinnej ekológie. Významnou mierou Ústav prispieva k vzdelávaniu na univerzitách s cieľom zvýšiť úroveň ekologického vedomia.